如果物流公司承认货物丢失但拒绝赔偿，你可以依据《中华人民共和国合同法》的相关规定，通过法律途径维护自己的权益。根据该法第三百一十一条，承运人对运输过程中货物的毁损、灭失承担损害赔偿责任。你可以先尝试与物流公司进行协商，若协商无果，可以考虑向法院提起诉讼，要求物流公司进行赔偿。在此过程中，保留好相关证据，如物流单据、货物价值证明等，以备不时之需。
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在不同的交易阶段，货物丢失的处理方式有所不同：若交易还在发货阶段，可要求卖家重新发货或延长确认收货时间；若交易即将超时且未收到货，应及时申请退款；若交易已成功但货物未收到，应在15天内发起售后申请，选择退款，协商无果后可申请客服介入。
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从法律角度，确保权益不受损害的关键在于：保留好所有与交易和物流相关的证据，如物流单据、交易记录、聊天记录等；及时与卖家和物流公司沟通，了解货物丢失的具体情况；根据交易阶段的不同，采取相应的措施，如申请退款、发起售后申请等；若协商无果，可考虑向消费者协会投诉或向法院提起诉讼。