商业用地赔偿标准是：1、若房屋和土地分开补偿，则土地按商业用途补偿，房屋及其附属物按重置成新价补偿。2、如房地合一补偿，则按照商业房地产市场价值进行补偿。还有搬迁补助、正常营业的还有停产停业损失。政府征用商业用地所支付的补偿金，应由被征用土地方与征用方进行协商，协商后的补偿金应当在工程完工前，一次性或分批次付清。征收土地的，按照被征收土地的原用途给予补偿。